Il logo della Fondazione M.E.C. è rappresentato da cinque strisce di colori differenti che convergono in un punto unico. I colori indicano la libertà dei genitori di poter scegliere liberamente il percorso di istruzione e di educazione dei propri figli tra le scuole pubbliche statali e le scuole pubbliche paritarie, senza condizionamenti di natura sociale, culturale, religiosa ed economica. Le scelte delle famiglie, garantite dallo Stato, non sono in contraddizione fra loro ma “convergono” nell’unico obiettivo di una scuola di tutti e per tutti, espressa dallo slogan “Insieme per l’educazione”.